Our project ISOB: In silico Identifizierungs- und Optimierungsplattform für Biologics has just been granted by the BMWi as a ZIM project.

The partners are NanoTemper Technologies GmbH, Dynamic Biosensors GmbH, and the Philipps-University of Marburg.

Abstract (German)

Das Konsortium beabsichtigt die Entwicklung einer „in silico Optimierungsplattform“ zur wirtschaftlicheren Entwicklung von besseren Wirkstoffen. Dabei ist die Hauptinnovation ein Machine-Learning Modul mit neuartigen Algorithmen, eingebettet in eine bedienungsfreundliche “In-the-cloud-Software”, das erstmals nicht nur die Identifizierung, sondern darüber hinaus die in silico Vorhersage von optimierten biologischen Leitstrukturen aus digitalisierten biophysikalischen Experimenten ermöglicht. Durch eine Schnittstelle werden biophysikalische Messdaten und digitale Daten in einer gemeinsamen Datenbank in der Cloud vereint. Die Software soll als “Software as a Service (Saas)”, sowohl eigenständig als auch im Bundle mit Messgeräten, vertrieben werden. Die Entwicklung dieses Produktes erfolgt am Beispiel der für die Onkologie relevanten Kinasen, mit Peptiden als Wirkstoffklasse. Eine Übertragbarkeit auf alle denkbaren Biologicals, insbesondere der Antikörper (Abs, Bicycles, Fabs etc.) sowie die Anwendbarkeit für alle gängigen Screeningverfahren, wird dabei berücksichtigt, indem z.B. gleich mit Puffern und Substanzkonzentrationen, die für Proteine relevant sind, gearbeitet wird. Die tatsächliche Übertragung auf die komplexen Proteine (Polypeptide) kann dann in einem Anschlussprojekt erfolgen.